📖 КАК ПРОЧИТАЛИ ГЕНОМ
Проект «Геном человека» шёл с 1990 по 2003 год: около 20 центров из шести стран. Всё вместе, с разработкой технологий, стоило примерно 2,7 млрд долларов (в ценах 1991 года) — это цена проекта, а не «одного генома».
26 июня 2000 года Билл Клинтон и Тони Блэр объявили о черновом варианте. В феврале 2001-го вышли две статьи: международного консорциума — в Nature, компании Celera Genomics Крейга Вентера — в Science. Celera читала геном методом «дробовика»; соревнование ускорило работу и обострило спор, можно ли патентовать гены и закрывать данные.
Версия 2003 года покрывала около 92% генома. Самые повторяющиеся участки оставались пустыми до 2022 года: 1 апреля консорциум T2T («от теломеры до теломеры») показал в Science первую полную сборку без пропусков — 3,055 млрд пар и около 200 млн пар нового материала. Y-хромосому целиком собрали в 2023-м.
В мае 2023 года вышел черновой пангеном: 94 сборки от 47 людей разного происхождения. Идея простая: один геном не может представлять всё человечество.
Цена прочтения рухнула: около 95–100 млн долларов в 2001 году и около 500 долларов к 2022-му — быстрее закона Мура. Клинический анализ с толкованием стоит заметно дороже.
Методы: секвенирование Фредерика Сэнгера (1977) — основа проекта, за него Сэнгер получил вторую Нобелевскую премию (1980; первую — в 1958-м за инсулин). С середины 2000-х — NGS, миллионы коротких фрагментов параллельно. Длинные чтения PacBio и нанопор Oxford Nanopore сделали возможной полную сборку T2T.
🎯 Шаг: большая задача читается по фрагментам. Раздели свою цель на кусочки и прочитай сегодня один.
База знаний · 🧬 ДНК и геном
Как прочитали геном
Дальше: На что гены влияют